Influencing factors for negative conversion time of viral RNA from nasopharyngeal swabs of patients with coronavirus disease 2019

doi:10.3877/cma.j.issn.1674-1358.2022.01.003

Abstract

Abstract:

Objective

To investigate the clinical and laboratory characteristics which influence the negative conversion time of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) ribonucleic acid (RNA) of nasopharyngeal swab in patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19).

Methods

Total of 121 patients diagnosed as COVID-19 were admitted to Beijing Ditan Hospital, Capital Medical University, from June 11st 2020 to July 1st 2020. Clinical data of these patients were collected in this single-center retrospective case-control study. Cox proportional hazard regression model analysis was used to investigate the independent factors influencing negative conversion time of virus RNA in nasopharyngeal swabs of patients with COVID-19.

Results

The period from illness onset to the first day of the two consecutive negative results of nucleic acid of 121 patients with COVID-19 were [27 (23, 34)] days. Multivariate Cox regression analysis indicated that older than 45 years old (HR = 0.583, 95%CI: 0.388-0.877, P = 0.010) and body temperature > 39 ℃ (HR = 0.482, 95%CI: 0.254-0.914, P = 0.025) were all independent risk factors for negative conversion time of SARS-CoV-2 RNA, while CD8⁺ T cells > 300 cells/μl (HR = 1.708, 95%CI: 1.102-2.647, P = 0.017) was an independent protective factor affecting negative conversion time of SARS-CoV-2 RNA.

Conclusions

Predictors such as age > 45 years old, hyperthermia and CD8⁺ T lymphocyte count ≤ 300 cells/μl might help clinicians early identify the patients who may present with a longer positive duration of SARS-CoV-2 RNA, and adjust treatment strategies and isolation protocols.

Key words: Coronavirus disease 2019 (COVID-19), Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), Negative conversion time

Fang Qian, Meihua Song, Di Tian, Ziruo Ge, Tingyu Zhang, Aibin Wang, Bing Han, Yanli Xu, Zhihai Chen. Influencing factors for negative conversion time of viral RNA from nasopharyngeal swabs of patients with coronavirus disease 2019[J]. Chinese Journal of Experimental and Clinical Infectious Diseases(Electronic Edition), 2022, 16(01): 16-24.

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Figures/Tables 4

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项目		数值
年龄[M（P25，P75），岁]		43.0（31.0，51.0）
性别[例（%）]
	男	72（59.5）
	女	49（40.5）
基础疾病[例（%）]
	高血压病	7（5.8）
	冠心病	4（3.3）
	糖尿病	4（3.3）
	慢性支气管炎	2（1.7）
临床症状[例（%）]
	发热	75（62.0）
	乏力	32（26.4）
	咳嗽	59（48.8）
	咯痰	40（33.1）
	咽痛	29（24.0）
	胸闷	17（14.0）
诊断分型[例（%）]
	无症状感染者	7（5.8）
	轻型	12（9.8）
	普通型	92（76.0）
	重型	7（5.8）
	危重型	3（2.5）
入院实验室指标[M（P25，P75）]
	WBC（×10⁹/L）	4.9（3.8，6.1）
	NE（×10⁹/L）	2.8（2.0，3.9）
	LY（×10⁹/L）	1.5（1.2，2.0）
	NK细胞（个/μl）	212.0（131.0，298.0）
	B细胞（个/μl）	175.0（124.0，258.0）
	CD3⁺ T细胞（个/μl）	910.0（692.0，1399.0）
	CD4⁺ T细胞（个/μl）	567.0（398.0，788.0）
	CD8⁺ T细胞（个/μl）	318.0（225.0，490.0）
	CD4⁺/CD8⁺ T	1.6（1.4，2.2）
	ALT（U/L）	19.0（12.0，34.5）
	AST（U/L）	20.6（16.3，29.0）
	ALB（g/L）	43.5（41.0，45.3）
	BUN（mmol/L）	4.5（3.6，5.5）
	CREA（μmol/L）	63.9（53.4，74.3）
	CRP（mg/L）	2.7（0.8，10.0）
	D-Dimer（mg/L）	0.2（0.1，0.4）
	LDH（U/L）	193.2（169.8，231.8）

项目		数值
年龄[M（P25，P75），岁]		43.0（31.0，51.0）
性别[例（%）]
	男	72（59.5）
	女	49（40.5）
基础疾病[例（%）]
	高血压病	7（5.8）
	冠心病	4（3.3）
	糖尿病	4（3.3）
	慢性支气管炎	2（1.7）
临床症状[例（%）]
	发热	75（62.0）
	乏力	32（26.4）
	咳嗽	59（48.8）
	咯痰	40（33.1）
	咽痛	29（24.0）
	胸闷	17（14.0）
诊断分型[例（%）]
	无症状感染者	7（5.8）
	轻型	12（9.8）
	普通型	92（76.0）
	重型	7（5.8）
	危重型	3（2.5）
入院实验室指标[M（P25，P75）]
	WBC（×10⁹/L）	4.9（3.8，6.1）
	NE（×10⁹/L）	2.8（2.0，3.9）
	LY（×10⁹/L）	1.5（1.2，2.0）
	NK细胞（个/μl）	212.0（131.0，298.0）
	B细胞（个/μl）	175.0（124.0，258.0）
	CD3⁺ T细胞（个/μl）	910.0（692.0，1399.0）
	CD4⁺ T细胞（个/μl）	567.0（398.0，788.0）
	CD8⁺ T细胞（个/μl）	318.0（225.0，490.0）
	CD4⁺/CD8⁺ T	1.6（1.4，2.2）
	ALT（U/L）	19.0（12.0，34.5）
	AST（U/L）	20.6（16.3，29.0）
	ALB（g/L）	43.5（41.0，45.3）
	BUN（mmol/L）	4.5（3.6，5.5）
	CREA（μmol/L）	63.9（53.4，74.3）
	CRP（mg/L）	2.7（0.8，10.0）
	D-Dimer（mg/L）	0.2（0.1，0.4）
	LDH（U/L）	193.2（169.8，231.8）

变量		β值	SE值	Wald χ²值	P值	HR值	95%CI
性别
	男^a
	女	-0.165	0.190	0.756	0.384	0.874	0.584~1.231
年龄
	≤ 45岁^a
	> 45岁	-0.603	0.193	9.798	0.002	0.547	0.375~0.798
病情
	非重症^a
	重症	-0.627	0.334	3.516	0.061	0.534	0.277~1.029
体温
	≤ 39℃^a
	> 39℃	-0.716	0.262	7.495	0.006	0.489	0.293~0.816
发热
	无^a
	有	-0.257	0.189	1.842	0.175	0.773	0.533~1.121
乏力
	无^a
	有	-0.373	0.21	3.143	0.076	0.689	0.456~1.040
咳嗽
	无^a
	有	-0.283	0.183	2.391	0.122	0.753	0.526~1.079
咯痰
	无^a
	有	-0.247	0.195	1.605	0.205	0.781	0.533~1.145
咽痛
	无^a
	有	-0.305	0.217	1.974	0.160	0.737	0.482~1.128
胸闷
	无^a
	有	-0.602	0.267	5.085	0.024	0.548	0.324~0.924
WBC（× 10⁹/L）
	≤ 4^a
	> 4	0.110	0.202	0.298	0.585	1.117	0.751~1.660
NE（× 10⁹/L）
	≤ 2.5^a
	> 2.5	0.051	0.188	0.075	0.785	1.053	0.728~1.523
LY（× 10⁹/L）
	≤ 1^a
	> 1	0.131	0.257	0.261	0.609	1.140	0.689~1.886
NK细胞（个/μl）
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	> 200	-0.086	0.183	0.219	0.640	0.918	0.641~1.314
B细胞（个/μl）
	≤ 200^a
	> 200	0.099	0.188	0.275	0.600	1.104	0.764~1.595
CD3⁺ T细胞（个/μl）
	≤ 1 000^a
	> 1 000	0.440	0.187	5.502	0.019	1.552	1.075~2.241
CD4⁺ T细胞（个/μl）
	≤ 350^a
	> 350	-0.030	0.238	0.015	0.901	0.971	0.608~1.549
CD8⁺ T细胞（个/μl）
	≤ 300^a
	> 300	0.569	0.19	8.973	0.003	1.767	1.217~2.564
CRP（mg/L）
	≤ 5^a
	> 5	-0.042	0.19	0.05	0.823	0.958	0.661~1.390
D-Dimer（mg/L）
	≤ 0.5^a
	> 0.5	-0.512	0.221	5.354	0.021	0.600	0.389~0.925
ALB（g/L）
	≤ 40^a
	> 40	0.297	0.239	1.541	0.214	1.346	0.842~2.150
LDH（U/L）
	≤ 250^a
	> 250	-0.350	0.238	2.169	0.141	0.705	0.442~1.123

变量		β值	SE值	Wald χ²值	P值	HR值	95%CI
性别
	男^a
	女	-0.165	0.190	0.756	0.384	0.874	0.584~1.231
年龄
	≤ 45岁^a
	> 45岁	-0.603	0.193	9.798	0.002	0.547	0.375~0.798
病情
	非重症^a
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体温
	≤ 39℃^a
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发热
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乏力
	无^a
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咳嗽
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咯痰
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咽痛
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	有	-0.305	0.217	1.974	0.160	0.737	0.482~1.128
胸闷
	无^a
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WBC（× 10⁹/L）
	≤ 4^a
	> 4	0.110	0.202	0.298	0.585	1.117	0.751~1.660
NE（× 10⁹/L）
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NK细胞（个/μl）
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	> 200	-0.086	0.183	0.219	0.640	0.918	0.641~1.314
B细胞（个/μl）
	≤ 200^a
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CD3⁺ T细胞（个/μl）
	≤ 1 000^a
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CD4⁺ T细胞（个/μl）
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变量	β值	SE值	Wald χ²值	P值	HR值	95%CI
年龄> 45岁	-0.539	0.208	6.71	0.010	0.583	0.388~0.877
体温> 39 ℃	-0.729	0.326	4.99	0.025	0.482	0.254~0.914
胸闷	0.085	0.326	0.068	0.794	1.087	0.575~2.062
CD3⁺ T细胞> 1 000个/μl	-0.108	0.232	0.217	0.642	0.898	0.569~1.415
CD8⁺ T细胞> 300个/μl	0.535	0.224	5.727	0.017	1.708	1.102~2.647
D-Dimer> 0.5 mg/L	-0.303	0.238	1.631	0.202	0.738	0.463~1.176

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