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  • 宏基因组二代测序在鲍曼不动杆菌肺炎混合感染者诊疗中的应用
    孙国先, 蔡萍, 刘微丽, 孟丽君, 侯红玲
    中华实验和临床感染病杂志(电子版) . 2022, 16 (02): 115-121.
    摘要 ( 76 ) HTML ( 0 ) PDF ( 966 ) ( 4 )
    目的

    探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术对重症监护病房鲍曼不动杆菌肺炎混合感染者诊疗的应用价值。

    方法

    回顾性收集扬州大学附属医院2019年1月至2021年5月同时行肺泡灌洗液mNGS技术和传统病原检测的84例肺炎患者的基本资料、细菌培养以及mNGS检测结果、抗菌药物应用等。根据鲍曼不动杆菌感染的诊断标准和mNGS检测结果,将入组患者分为定植菌组(25例)、单一感染组(29例)和混合感染组(30例)。炎性指标、辛普森菌群多样性指数(SDI)、抗菌药物使用时间、使用强度、费用和总药费为正态分布的计量资料,采用t检验或ANOVA检验分析;患者年龄分布、基础疾病、发热时间分布、不同临床疗效和治疗转归占比均采用[例(%)]表示,组间比较采用卡方检验。

    结果

    入组的84例患者传统病原和mNGS检测鲍曼不动杆菌均为阳性,其中25例鲍曼不动杆菌定植和59例鲍曼不动杆菌肺炎患者;男性44例、女性40例,年龄[65.4(62,68)]岁。mNGS检测中,30例[50.85%(30/59)]检出混合感染;传统病原检测中,3例[5.08%(3/59)]检出混合感染,显著低于mNGS检测,差异有统计学意义(χ2 = 30.667、P < 0.001)。mNGS检出混合感染居前3位的病原体分别为人疱疹病毒(7例)、肺炎链球菌(5例)和耶氏肺孢子虫(5例)。定植菌组、单一感染组和混合感染组患者SDI分别为(0.77 ± 0.11)、(0.38 ± 0.16)和(0.34 ± 0.17),差异具有统计学意义(F = 65.411、P < 0.001)。单一感染组与混合感染组患者白细胞计数(t = 2.211、P = 0.031)、中性粒细胞比率(t = 2.068、P = 0.043)、C-反应蛋白(t = 2.024、P = 0.048)、抗菌药物费用(t = 2.279、P = 0.026)、抗菌药物使用强度(t = 2.161、P = 0.035)、住院天数(t = 2.664、P = 0.010)、总药费(t = 2.397、P = 0.020)和体温降至正常时间(t =-2.178、P = 0.034)]差异均有统计学意义。单一感染组患者治疗显效率高于混合感染组(82.76% vs. 56.67%,χ2 = 4.735、P = 0.047)。

    结论

    肺泡灌洗液mNGS技术在检测鲍曼不动杆菌肺炎混合感染方面优势明显,能够辅助临床优选抗菌药物,促进患者康复。

病原体种类 数量 核酸序列数 相对丰度(%)
人疱疹病毒 7 150(54,988)a
肺炎链球菌* 5 140(68,882)a 30.2(26.4,35.0)a
耶氏肺孢子虫 5 256(102,8 112)a 23.3(18.7,80.1)a
流感嗜血杆菌* 2 668、8014 31.1、81.0
肺炎克雷伯杆菌 2 152、341 13.5、35.0
细环病毒 2 176、2 061
屎肠球菌 2 142、42 278 1.0、78.3
茴香军团菌 2 246、820 8.1、22.6
隐球菌* 0
嗜麦芽窄食单胞菌 1 341 62.3
人型支原体 1 62 4.1
黄曲霉 1 743 31.0
铜绿假单胞菌 1 26 077 6.9
人偏肺病毒 1 801
卷曲乳杆菌 1 3 129 29.2
表2 混合感染组患者的病原体组成和mNGS检测结果
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