荧光定量PCR技术检测肺外结核患者样本临床应用

doi:10.3877/cma.j.issn.1674-1358.2018.03.010

目的

评估赛沛分子检测技术（结核分枝杆菌和利福平耐药基因）（GeneXpert MTB/RIF）检测心包和胸腔积液样本中结核分枝杆菌的有效性。

方法

收集2015年1月至2017年6月天门市第一人民人民医院和汉川市人民医院收治的286例结核病疑似患者的临床资料，分别收集158例胸腔积液和128例心包积液样品。每个样品均经过抗酸染色涂片镜检、罗氏培养基结核分枝杆菌培养（LJ培养）和GeneXpert MTB/RIF测定。使用结核分枝杆菌罗氏培养作为金标准，评估GeneXpert MTB/RIF技术检测MTB的有效性。

结果

在286例积液样本中，MTB通过LJ培养阳性者51例（17.8%），GeneXpert MTB/RIF测定阳性者43例（15%），抗酸染色镜检阳性者11例（3.8%）。GeneXpert技术灵敏度、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别为84.3%、100%、100%和96.7%，抗酸染色方法的灵敏度、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别为18.3%、99.1%、81.8%和85.4%。GeneXpert技术检查心包积液中MTB的灵敏度可达90%。GeneXpert MTB/RIF和抗酸染色镜检鉴定两种样本中结核分枝杆菌有效性的差异具有统计学意义（χ² = 233.199、33.715、P均< 0.001）。

结论

GeneXpert MTB/RIF技术对于检测胸腔和心包积液中的MTB具有高灵敏度和高特异性。

关键词: 结核性胸膜炎, 结核性心包炎, 赛沛分子检测技术（结核分枝杆菌和利福平耐药基因）, 肺外结核

Objective

To evaluate the effect of GeneXpert Mycobacterium tuberculosis/Rifampin (GeneXpert MTB/RIF) in detection of Mycobacterium tuberculosis in pericardial and pleural effusion samples.

Methods

From January 2015 to June 2017, data of 286 suspected cases with tuberculosis were collected from The First people’s Hospital and Hanchuan People’s Hospital. There were 158 cases with pleural effusion and 128 cases with pericardial effusion, respectively. Each sample was examined by acid fast staining, smear microscopy, LJ Culture and GeneXpert MTB/RIF assay, respectively. Taking Mycobacterium LJ culture as the gold standard, the effect of GeneXpert MTB/RIF in detecting MTB was evaluated.

Results

Among the 286 effusion samples, 5 (17.8%) were MTB positive for LJ cultured, 43 (15%) were MTB positive determined by GeneXpert MTB/RIF, and 11 (3.8%) were MTB positive detected by acid-fast stain microscopy. The sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of GeneXpert technology were 84.3%, 100%, 100% and 84.3%, respectively; while those of the acid fast stain method were 18.3%, 99.1%, 81.8% and 99.1%, respectively. The sensitivity of MTB in pericardial effusion was up to 90% detected by GeneXpert. GeneXpert MTB/RIF and acid-fast stain microscopy showed significant difference in the identification of Mycobacterium tuberculosis in two samples (χ² = 233.199, 33.715; all P < 0.001).

Conclusion

GeneXpert MTB/RIF technology has high sensitivity and specificity on detecting MTB in pleural effusion and pericardial effusion.

Key words: Tuberculous pleurisy, Tuberculous pericarditis, GeneXpert Mycobacterium tuberculosis/Rifampin, Extrapulmonary tuberculosis

表1 3种方法检测158例胸腔积液和128例心包积液样本阳性检出率

检测方法	胸腔积液（158例）	心包积液（128例）	合计（286例）
抗酸染色	8（5.06）	3（2.34）	11（3.85）
GeneXpert	30（18.99）	13（10.16）	43（15.04）
罗氏培养	33（20.89）	18（14.06）	51（17.83）

表1 3种方法检测158例胸腔积液和128例心包积液样本阳性检出率

检测方法	胸腔积液（158例）	心包积液（128例）	合计（286例）
抗酸染色	8（5.06）	3（2.34）	11（3.85）
GeneXpert	30（18.99）	13（10.16）	43（15.04）
罗氏培养	33（20.89）	18（14.06）	51（17.83）

表2 GeneXpert技术与罗氏培养检测结果（例）

样本类型	GeneXpert	罗氏培养		合计
样本类型	GeneXpert	阳性	阴性	合计
胸腔积液	阳性	13	0	13
胸腔积液	阴性	5	110	115
	合计	18	110	128
心包积液	阳性	30	0	30
心包积液	阴性	3	125	128
	合计	33	125	158
两者合计	阳性	43	0	43
两者合计	阴性	8	235	243
	总计	51	235	286

表2 GeneXpert技术与罗氏培养检测结果（例）

样本类型	GeneXpert	罗氏培养		合计
样本类型	GeneXpert	阳性	阴性	合计
胸腔积液	阳性	13	0	13
胸腔积液	阴性	5	110	115
	合计	18	110	128
心包积液	阳性	30	0	30
心包积液	阴性	3	125	128
	合计	33	125	158
两者合计	阳性	43	0	43
两者合计	阴性	8	235	243
	总计	51	235	286

表3 GeneXpert技术鉴定两种积液中结核分枝杆菌的有效性

样本类型	χ²值	P值	灵敏度（%）	特异性（%）	阳性预测值（%）	阴性预测值（%）
胸腔积液	88.425	< 0.001	72.2	100.0	100.0	95.6
心包积液	140.270	< 0.001	90.0	100.0	100.0	97.6
两者合计	233.199	< 0.001	84.3	100.0	100.0	96.7

表3 GeneXpert技术鉴定两种积液中结核分枝杆菌的有效性

样本类型	χ²值	P值	灵敏度（%）	特异性（%）	阳性预测值（%）	阴性预测值（%）
胸腔积液	88.425	< 0.001	72.2	100.0	100.0	95.6
心包积液	140.270	< 0.001	90.0	100.0	100.0	97.6
两者合计	233.199	< 0.001	84.3	100.0	100.0	96.7

表4 抗酸染色镜检技术与罗氏培养阳性例数（例）

样本类型	抗酸染色	罗氏培养		合计
样本类型	抗酸染色	阳性	阴性	合计
胸腔积液	阳性	2	1	3
胸腔积液	阴性	15	110	125
	合计	17	111	128
心包积液	阳性	7	1	8
心包积液	阴性	25	125	150
	合计	32	126	158
两者合计	阳性	9	2	11
两者合计	阴性	40	235	275
	合计	49	237	286

表4 抗酸染色镜检技术与罗氏培养阳性例数（例）

样本类型	抗酸染色	罗氏培养		合计
样本类型	抗酸染色	阳性	阴性	合计
胸腔积液	阳性	2	1	3
胸腔积液	阴性	15	110	125
	合计	17	111	128
心包积液	阳性	7	1	8
心包积液	阴性	25	125	150
	合计	32	126	158
两者合计	阳性	9	2	11
两者合计	阴性	40	235	275
	合计	49	237	286

表5 抗酸染色在两种积液中鉴定结核分枝杆菌的有效性

样本类型	卡方值	P值	灵敏度（%）	特异性（%）	阳性预测值（%）	阴性预测值（%）
胸腔积液	7.602	0.006	11.7	99.0	66.6	88.0
心包积液	23.594	< 0.001	21.8	99.2	87.5	83.3
两者合计	33.715	< 0.001	18.3	99.1	81.8	85.4

表5 抗酸染色在两种积液中鉴定结核分枝杆菌的有效性

样本类型	卡方值	P值	灵敏度（%）	特异性（%）	阳性预测值（%）	阴性预测值（%）
胸腔积液	7.602	0.006	11.7	99.0	66.6	88.0
心包积液	23.594	< 0.001	21.8	99.2	87.5	83.3
两者合计	33.715	< 0.001	18.3	99.1	81.8	85.4

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Clinical application of fluorescent quantitative PCR in detection of patients with extra-pulmonary tuberculosis

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