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中华实验和临床感染病杂志(电子版)

中华实验和临床感染病杂志(电子版) ›› 2016, Vol. 10 ›› Issue (02) : 193 -199. doi: 10.3877/cma.j.issn.1674-1358.2016.02.013

临床论著

趋化因子受体6基因与陕西汉中地区类风湿关节炎汉族人群相关性
闫铭锋1, 李晓波2,†(), 苏扬3, 李婷1, 陈苗2, 柴阳2   
  1. 1. 723000　汉中市，西安交通大学附属3201医院检验科
    2. 723000　汉中市，西安交通大学附属3201医院微免科
    3. 610072　成都市，四川省人民医院检验科
  • 收稿日期:2015-07-27 出版日期:2016-04-15
  • 通信作者: 李晓波

Association of chemokine (C-C motif) receptor 6 gene polymorphisms with susceptibility to rheumatoid arthritis in Hanzhong Area of Shanxi Province

Mingfeng Yan1, Xiaobo Li2,†(), Yang Su3, Ting Li1, Miao Chen2, Yang Chai2   

  1. 1. Department of Clinical Laboratory, 3201 Hospital Affiliated to Xi’an Jiaotong University, Hanzhong 723000, China
    2. Department of Microbiology and Immunology Laboratory, 3201 Hospital Affiliated to Xi’an Jiaotong University, Hanzhong 723000, China
    3. Department of Clinical Laboratory, Sichuan Provincial People’s Hospital, Chengdu 610072, China
  • Received:2015-07-27 Published:2016-04-15
  • Corresponding author: Xiaobo Li
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引用本文：

闫铭锋, 李晓波, 苏扬, 李婷, 陈苗, 柴阳. 趋化因子受体6基因与陕西汉中地区类风湿关节炎汉族人群相关性[J]. 中华实验和临床感染病杂志(电子版), 2016, 10(02): 193-199.

Mingfeng Yan, Xiaobo Li, Yang Su, Ting Li, Miao Chen, Yang Chai. Association of chemokine (C-C motif) receptor 6 gene polymorphisms with susceptibility to rheumatoid arthritis in Hanzhong Area of Shanxi Province[J]. Chinese Journal of Experimental and Clinical Infectious Diseases(Electronic Edition), 2016, 10(02): 193-199.

目的

探讨趋化因子受体6基因单核苷酸多态性位点与中国陕西汉中地区类风湿关节炎汉族人群的相关性。

方法

采用病例-对照研究方法，收集768例RA患者和960例正常对照DNA样本；用聚合酶链反应（PCR）法扩增目的条带，使用单碱基延伸法（SnapShot）对rs1331301、rs1556413、rs3093024、rs1854853和rs3093023位点基因分型，分析与RA的相关性。

结果

CCR6基因5个标签SNP位点均符合哈迪温伯格平衡（HWE），RA组和对照组基因型差异均无统计学意义（P > 0.05）。rs3093024位点A等位基因（OR = 1.22、P = 0.003），显性模式（OR = 1.33、P = 0.0048）RA组与对照组差异具有统计学意义。rs1854853位点A等位基因（OR = 1.20、P = 0.0067），显性模式（OR = 1.35、P = 0.0063），RA组与对照组差异具有统计学意义。rs3093023位点T等位基因（OR = 1.26、P = 0.0009），显性模式（OR = 1.38、P = 0.0015），隐性模式（OR = 1.33、P = 0.025），RA组与对照组差异有统计学意义。rs1331301和rs1556413两个SNP位点等位基因和显性、隐性模式，RA组与对照组差异均无统计学意义。

结论

CCR6基因rs3093023、rs3093024和rs1854853三个单核苷酸多态性位点，可能是陕西汉中地区汉族人类风湿关节炎的易感基因位点。

关键词: 趋化因子受体6基因, 类风湿关节炎, 单核苷酸多态性
Objectives

To assess the association of chemokine (C-C motif ) receptor 6 (CCR6) gene polymorphisms with rheumatoid arthritis (RA) among ethnic Han Chinese in Hanzhong Area of Shanxi Province.

Methods

The data of 768 patients with RA and 960 healthy controls were analyzed by case-control association method. All individuals were collected in Hanzhong Area of Shanxi Province of Han Chinese descent. Five (rs1331301, rs1556413, rs3093024, rs1854853 and rs3093023) single nucleotide polymorphisms (SNP) in CCR6 gene region were genotyped by the Snapshot method.

Results

There were a significant association of the rs3093024 [A] Allele (OR = 1.22, P = 0.003) and dominant model (OR = 1.33, P = 0.004) with RA susceptibility with Hanzhong of ShanXi Han Chinese population. The rs1854853 [A] Allele (OR = 1.20, P = 0.007) and Dominant model (OR = 1.35, P = 0.006) frequency distribution were significantly different between RA group and normal control group. Equally important, rs3093023 [T] Allele (OR = 1.26, P = 0.009), dominant model (OR = 1.38, P = 0.002) and recessive model (OR = 1.33, P = 0.025) frequency distribution were significantly different between RA group and normal control group. The rs1331301 and rs1556413 allele and genotyped polymorphisms were not significantly associated with RA susceptibility.

Conclusions

CCR6 gene of rs3093024, rs1854853 and rs3093023 are significantly associated with rheumatoid arthritis of Han Chinese population in Hanzhong Area of Shanxi Province.

Key words: Chemokine (C-C motif) receptor 6 (CCR6) gene, Single nucleotide polymorphism, Rheumatoid arthritis
表1 类风湿关节炎组和正常对照组流行病学资料
分组 例数 性别（男/女） 年龄（±s，岁） 患病时间（±s，年） RF+ [例（%）] 抗-CCP阳性[例（%）]
RA组 768 247/521 49.5 ± 12.3 3.81 ± 2.9 643（83.7） 526（68.5）
对照组 960 375/585 48.9 ± 12.8 — — —
统计量   χ2 = 6.612b t = 0.551a — — —
P值   0.011 0.547 — — —
表2 ACCP+ RA组和正常对照组流行病学资料
分组 例数 性别（男/女） 年龄（±s，岁） 患病时间（±s，年）
ACCP+ RA组 526 155/371 47.7 ± 10.2 3.81 ± 2.9
对照组 960 375/585 48.9 ± 12.8 —
统计量   χ2 = 13.634b t=3.824a —
P值   0.000 0.044 —
表3 CCR6基因SNPs位点PCR及SNapShot引物设计
SNP   引物序列（5'→3'） 退火温度（℃） 产物大小（bp）
rs1331301 正向 GCAGATGGCTTGGGTTTAG 58 800
  反向 GAGGTCGTCATCCTGGTAG
  SnapShot ACTAAGGAATGATAATATTCTGAAATTGTC
rs1556413 正向 AGCCGTTGGCGTTTCCTAT 58 690
  反向 ACTGCTGCCTCCTTCACCC
  SnapShot CCTAAGTGGAGAAGGTAACCTAGATTTCCCCTTAAATTAC
rs3093024 正向 CCCTGTGACCTGCTCTTCT 58 479
  反向 CCATTTACTTCCCACCTTTT
  SnapShot GGAGCTCCTCTGTGCTCCCTCCTGTGAACTGGACGCTCGC
rs1854853 正向 AAGGTGGGAAGTAAATGGC 58 503
  反向 TGGAGGGACAGGAAGAAGA
  SnapShot CCAGCTACTT TATGGGGTAG
rs3093023 正向 TCTGCCTGGAAACTTATTG 58 369
  反向 GGATGGAGATTGAGACCCT
  SnapShot TATTGAAACTTCCTCAAATTTAAAATCACA
表4 CCR6基因SNPs位点等位基因频率分布
SNP 位置 等位基因 HWE RA组[例（%）] 对照组[例（%）] OR值（95%CI） P值 *P值
RA组 对照组
rs1331301 Chr6：167089150 C 0.463 0.944 701（45.6） 828（43.1） 1.11（0.97～1.27） 0.139 0.128
    A     835（54.4） 1 092（56.9）      
rs1556413 Chr6：167111255 A 0.697 0.615 693（45.1） 824（42.9） 1.09（0.96～1.25） 0.195 0.181
    G     843（54.9） 1 096（57.1）      
rs3093024 Chr6：167119305 A 0.245 0.665 646（42.1） 715（37.2） 1.22（1.07～1.40） 0.004 0.003
    G     890（57.9） 1 205（62.8）      
rs1854853 Chr6：167119574 A 0.346 0.799 777（50.6） 883（46.0） 1.20（1.05～1.38） 0.007 0.007
    G     759（49.4） 1 037（54.0）      
rs3093023 Chr6：167120802 T 0.492 0.933 655（42.6） 713（37.1） 1.26（1.10～1.44） 0.001 0.009
    C     881（57.4） 1 207（62.9）      
表6 ACCP阳性RA组和对照组CCR6基因SNPs位点等位基因频率分布
SNP 等位基因 HWE ACCP+ RA组[例（%）] 对照组[例（%）] OR值（95%CI） P值 *P值
RA组 对照组
rs1331301 C 0.325 0.944 478（45.4） 828（43.1） 1.10（0.94～1.28） 0.225 0.208
  A     574（54.6） 1092（56.9）      
rs1556413 A 0.576 0.615 488（46.4） 824（42.9） 1.15（0.99～1.34） 0.068 0.061
  G     564（53.6） 1096（57.1）      
rs3093024 A 0.405 0.665 451（42.9） 715（37.2） 1.27（1.09～1.47） 0.003 0.002
  G     601（57.1） 1205（62.8）      
rs1854853 A 0.215 0.799 541（51.4） 883（46.0） 1.24（1.07～1.45） 0.005 0.004
  G     511（48.6） 1037（54.0）      
rs3093023 T 0.230 0.933 449（42.7） 713（37.1） 1.26（1.08～1.47） 0.003 0.003
  C     603（57.3） 1207（62.9）      
表7 ACCP阳性RA组和对照组等位基因及显性模型和隐性模型频率分布
SNP 基因型 ACCP+[例（%）] 对照[例（%）] 显性模式 隐性模式
OR值（95%CI） P值 *P值 OR值（95%CI） P值 *P值
rs1331301 CC 103（19.6） 178（18.5） 1.18（0.94～1.49） 0.153 0.142 1.07（0.82～1.40） 0.624 0.605
  AC 272（51.7） 472（49.2）            
  AA 151（28.7） 310（32.3）            
rs1556413 AA 110（20.9） 173（18.0） 1.21（0.96～1.53） 0.106 0.096 1.20（0.92～1.57） 0.175 0.159
  AG 268（51.0） 478（49.8）            
  GG 148（28.1） 309（32.2）            
rs3093024 AA 92（17.5） 130（13.5） 1.38（1.10～1.73） 0.005 0.005 1.35（1.01～1.81） 0.041 0.030
  AG 267（50.8） 455（47.4）            
  GG 167（31.7） 375（39.1）            
rs1854853 AA 132（25.1） 205（21.4） 1.45（1.14～1.86） 0.003 0.003 1.23（0.96～1.59） 0.100 0.084
  AG 277（52.7） 473（49.3）            
  GG 117（22.2） 282（29.4）            
rs3093023 TT 90（17.1） 133（13.9） 1.41（1.13～1.76） 0.003 0.003 1.28（0.96～1.72） 0.093 0.079
  CT 269（51.1） 447（46.6）            
  CC 167（31.7） 380（39.6）            
表5 CCR6基因SNPs位点显性模型和隐性模型频率分布
SNP 基因型 RA组[例（%）] 对照组[例（%）] 显性模式 隐性模式
OR值（95%CI） P值 *P值 OR值（95%CI） P值 *P值
rs1331301 CC 165（21.5） 178（18.5） 1.10（0.90～1.35） 0.354 0.339 1.20（0.95～1.52） 0.128 0.109
  AC 371（48.3） 472（49.2）            
  AA 232（30.2） 310（32.3）            
rs1556413 AA 159（20.7） 173（18.0） 1.08（0.88～1.33） 0.444 0.427 1.19（0.93～1.51） 0.160 0.152
  AG 375（48.8） 478（49.8）            
  GG 234（30.5） 309（32.2）            
rs3093024 AA 128（16.7） 130（13.5） 1.33（1.09～1.62） 0.005 0.005 1.28（0.98～1.66） 0.070 0.068
  AG 390（50.8） 455（47.4）            
  GG 250（32.6） 375（39.1）            
rs1854853 AA 190（24.7） 205（21.4） 1.35（1.09～1.68） 0.007 6.259×10-3 1.21（0.97～1.52） 0.096 0.083
  AG 397（51.7） 473（49.3）            
  GG 181（23.6） 282（29.4）            
rs3093023 TT 135（17.6） 133（13.9） 1.38（1.13～1.68） 0.002 1.536×10-3 1.33（1.02～1.72） 0.034 0.025
  CT 385（50.1） 447（46.6）            
  CC 248（32.3） 380（39.6）            
表8 CCR6基因一个连锁不平衡区域中3个SNP单倍体频率分布
单倍体型 RA组频率 对照组频率 χ2值 OR值（95%CI） P值
G-G-C 0.490 0.539 8.189 0.82（0.72～0.94） 0.004
A-A-T 0.421 0.370 9.421 1.24（1.08～1.42） 0.002
G-A-C 0.084 0.088 0.126 0.96（0.75～1.22） 0.723
图1 CCR6基因5个SNP位点连锁图
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