全基因组关联分析为多因素所诱发肝脏疾病开启了识别宿主遗传因素的渠道

doi:10.3760/cma.j.issn.1674-1358.2019.04.101

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Masashi MIZOKAMI

国立全球健康与医学中心

出版日期:2019-08-15

Masashi MIZOKAMI为国立全球健康与医学中心基因组医学科学项目总监。教育和职业背景：1990-1991年于英国伦敦国王学院医院肝脏科临床研究员；1983-1985年于日本三岛国立遗传学研究所Gojobori T教授团队进行研究培训；1976-1978于名古屋市立大学医学院附属医院第二医学院参加临床培训；1970-1976于名古屋市立大学攻读医学博士学位；1998-1919年，任日本名古屋市名古屋市立大学医学院副教授；2000-2008年，担任名古屋市立大学医学研究所临床与分子信息医学系主任兼教授；2016年担任国家全球卫生中心基因组医学科学项目主任；2008-2016年，任国立全球健康与医学中心肝炎研究中心主任；2000年至今，担任名古屋市立大学肝脏免疫学系教授。临床和学术研究方向：该专家研究方向为肝炎病毒与宿主基因组之间的相互作用。对肝炎病毒的不同基因型及其序列亚型进行分类并进一步研究其基因组突变，将为肝炎病毒感染者不同临床特征的发生提供理论依据。

Masashi MIZOKAMI.全基因组关联分析为多因素所诱发肝脏疾病开启了识别宿主遗传因素的渠道[J/CD].中华实验和临床感染病杂志（电子版）,2019,13（4）：352.

中华实验和临床感染病杂志(电子版) 2019, 13 (04): 352 -352. doi: 10.3760/cma.j.issn.1674-1358.2019.04.101

内容简介

本视频重点介绍全基因组关联研究（genome wide association study，GWAS）为识别多因素肝病的宿主遗传因素提供了方法。国际化数据库（EMABL/GenBank/DDBJ）始于1980年，自人类基因组计划于2003年取得成功以后基因组序列迅速增加；肝炎病毒数据库建立始于1998年，自此肝炎病毒基因序列在全世界范围内持续增加。研究显示可应用单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）来探讨为何HBV感染会有不同的临床表现，"SNP"于2007年被《Science》评为突破性成果。GWAS检测可以分析SNP相关的疾病和性状，也可用于疗效预测。感染性疾病的严重程度由病原体与宿主间相互作用决定，本视频讲述了亚洲人群HBV感染的自然病程，提出GWAS可识别HBV感染的宿主因素，即HLA-DP区域。全球范围内HBV感染者具有不同临床表现，可使用GWAS遗传分析来有效地识别人类多因素疾病的宿主遗传因子（如IL-28B对HCV治疗的药物反应和HLA Ⅱ类基因对CHB的敏感性等）。现有多种因素（如人口结构等）可导致GWAS结果不明确；而Meta分析和Replication分析可能进一步确定与多因素所致肝脏疾病相关的宿主遗传因素。

关键词: 全基因组, 关联分析, 多因素, 诱发肝脏疾病, 识别宿主, 遗传因素

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